Arbetsbeskrivning

Postdoktor inom exposomanalyser

Vill du arbeta med exposomanalyser och metabolomik i en kliniknära miljö, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som postdoktor på Uppsala universitet.

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.

Vi söker nu en mycket ambitiös och driftig postdoktor som ska jobba med oss med fokus på exposomanalyser inom kliniska frågeställningar. Vår tvärvetenskapliga verksamhet på Klinisk Kemi, vid institutionen för Medicinska vetenskaper, är förlagd på Akademiska sjukhuset. Vi har dessutom en mycket hög kompetens inom AI och djupinlärande metoder och hur dessa kan användas för att möjliggöra individanpassade behandlingsformer i framtidens vård.

Arbetsuppgifter

Du kommer att arbeta i forskningsprojekt som använder avancerade statistiska modeller och maskininlärning för att analysera komplexa biomedicinska data, inklusive masspektrometri-data och registerdata (t.ex. elektroniska journaldata). Arbetsuppgifterna innefattar förbehandling, kvalitetskontroll och analys av olika typer av högdimensionella data. Du kommer att samverka i avancerade statistiska analyser för att studera samband mellan biomarkörer, miljöfaktorer och sjukdomsutfall/förlopp, samt visualisera och tolka resultat. Beroende på din bakgrund kan arbetet även inkludera analys av register- och journaldata samt utveckling och tillämpning av maskininlärningsmetoder. I arbetet ingår även att dokumentera arbetsflöden och analysresultat i enlighet med god forskningssed. Vidare förväntas det att du är behjälplig i statistiska analyser inom andra projekt i gruppen. Du förväntas aktivt delta i forskningsmöten och samarbeta både inom den egna forskargruppen och med externa samarbetspartners.

Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen inom bioinformatik, miljömedicin eller en utländsk examen som bedöms som relevant. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare.
• Minst 5 års dokumenterad erfarenhet av förbehandling och kvalitetskontroll av masspektrometri-data
• Dokumenterad erfarenhet av arbete med oriktad masspektormetridata
• Dokumenterad erfarenhet av masspektrometribaserad dataanalys och metabolitidentifiering samt användning av verktyg såsom OpenMS och SIRIUS
• Erfarenhet av statistiska analyser av masspektrometri-data med fokus på metabolik och exposomanalyser, inklusive regressionsmodeller och överlevnadsanalyser
• Minst 5 års dokumenterad erfarenhet av programmering med R eller Python
• Erfarenhet av att analysera samband mellan exponeringar, registerdata, och sjukdomsutfall i epidemiologiska studier
• Erfarenhet av undervisning och handledning av studenter
• Erfarenhet av att skriva vetenskapliga artiklar samt ansökan om forskningsanslag
• Minst en publicerad artikel som första författare med så kallad 5-år Impakt faktor över 15
• Mycket god förmåga att uttrycka dig i tal och skrift på engelska, inklusive vetenskaplig documentation

Önskvärt/meriterande i övrigt

• Erfarenhet av arbete inom kliniknära forskningsprojekt, särskilt projekt som involverar hantering och analys av patientdata
• Erfarenhet av arbete med programvaran TraceFinder för detektion och kvantifiering av specifika ämnen
• Erfarenhet av att skapa och dokumentera reproducerbara analysflöden
• Erfarenhet av datahantering av stora datamängder
• Erfarenhet av att arbeta med enkätdata samt data från elektroniska journaler
• Mycket god förmåga att uttrycka dig i tal och skrift på svenska
• Erfarenhet av mixanalyser (quantile G-computation och WQS), överlevnadsanalyser (Cox proportional hazard model), regressionsmodeller, samt mediatoranalyser
• Erfarenhet av avancerad dataanalys, inklusive GitHub, Docker/Singularity, Nextflow, maskininlärnings- och djupinlärningsmodeller såsom grafneurala nätverk, LSTM, Transformers och CNN:er, samt metoder för conformal prediction och explainable AI.

Om anställningen

Anställningen är tidsbegränsad i två år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 261001ellerenligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Forskningsledare Kim Kultima ([email protected]) och doktor Ida Erngren ([email protected])

Välkommen med din ansökan senast den 28 juli 2026, UFV-PA 2026/2345.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - [email protected], Seko - [email protected], ST (OFR/S) - [email protected]