Arbetsbeskrivning

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor. Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet. Om arbetsplatsen Systems Immunology Lab söker en nyfiken, driven kandidat med erfarenhet av beräkningsbiologi och human immunologi för en Datadriven Life Sciences (DDLS) doktorandtjänst inom systemimmunologi. Leds av biträdande universitetslektor Camila Consiglio, använder vårt team multiomikteknologier med hög genomströmning och avancerade beräkningsmetoder för att utforska mekanismerna för den mänskliga immunreproduktiva överhörningen. Projektöversikt: Detta doktorandprojekt kommer att utforska den komplexa interaktionen mellan immun- och reproduktionssystemen, med fokus på hur könshormoner som testosteron och östrogen påverkar immunfunktionen och reproduktiva resultat. Forskningen kommer att undersöka immunreproduktiv överhörning i två kohorter: kvinnor med polycystiskt ovariesyndrom (PCOS) som naturligt har högre testosteronnivåer, och kvinnor som genomgår provrörsbefruktning (IVF). Projektet syftar till att avslöja hur metabola och reproduktiva faktorer påverkar immuniteten, och hur immunsvar påverkar IVF-framgång. I slutändan strävar studien efter att ge en djupare förståelse av det immun-endokrina förhållandet och dess roll i både reproduktion och immunhälsa. Vi erbjuder Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss Kravprofil Krav för anställningen är: • Civilingenjör inom bioinformatik, biomedicin, statistik, kvantitativ biologi eller liknande disciplin eller motsvarande • Flytande i beräkningsprogrammering, helst med R eller python • Erfarenhet av beräkningsbiologi/omik dataanalys • Bakgrundsförståelse för och erfarenhet av immunologisk forskning • Kunskaper i muntlig och skriftlig kommunikation på engelska • Stark kommunikations-, presentations- och skrivförmåga Meriterande för anställningen är: - Erfarenhet av systemimmunologiska metoder • Erfarenhet av kuration, förbearbetning och/eller analys av bulk RNAseq, scRNAseq, Olink proteomics eller andra typer av omics data • Bakgrund i multi-omics integration • Bekantskap med git och GitHub • Kännedom om bästa praxis inom reproducerbarhet och öppen vetenskap, såsom användning av behållare • Erfarenhet av att använda högpresterande datorkluster Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Uppdragen kräver att du har förmåga att arbeta självständigt samt förmåga att samarbeta väl med andra i forskargruppen och forskare utanför ämnesområdet. Det kräver också att du är tålmodig, detaljorienterad och noggrann. Arbetsuppgifter och ansvarsområden I detta doktorandprojekt kommer du att tillämpa systemimmunologiska metoder för att undersöka människans immunreproduktiva överhörning med hjälp av olika högkapacitetsteknologier. Uppdraget omfattar transkriptomisk (bulk och sc-mRNA-seq), epigenomisk (ATACseq, CUT&RUN), proteomisk (Olink analyser) och sammansättnings- och immunfenotypisk profilering (högdimensionell cytometri). Arbetsuppgifter inkluderar datakurering och bearbetning, och sammansättning, redigering och exekvering av beräkningsskript/arbetsflöden. Andra arbetsuppgifter inkluderar projektledning, skrivande av stipendier och manuskript, presentation på nationella och internationella konferenser, deltagande på seminarier, informellt mentorskap för andra anställda samt att arbeta tillsammans med labbmedlemmar och samarbetspartners. Behörighet Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Bedömningsgrund Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen. Villkor Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§. Övrigt Anställningen är tidsbegränsad till fyra år på heltid enligt HF 5 kap 7§ med önskat tillträdesdatum 241201 eller enligt överenskommelse. Så här söker du Ansökan ska innehålla allt av följande: - Ett personligt motiveringsbrev på en sida på engelska - CV, som visar hur du passar denna specifika doktorandtjänst enligt avsnittet "Krav". CV ska innehålla två referenser från tidigare handledare. - Du bevis på behörighet (MSc-diplom, indikation på MSc-avslutning före startdatum, eller bevis på poäng). Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen. Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning. Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.