Arbetsbeskrivning

Institutionen för biokemi och biofysik, institutionens lokaler ligger huvudsakligen i Arrheniuslaboratorierna tillsammans med de andra kemiinstitutionerna och andra institutioner inom Naturvetenskapliga fakulteten. Närmare 270 personer, varav ungefär 60 doktorander, är för närvarande verksamma vid institutionen. Forskningen är av absolut världsklass och spänner över flera stora områden. Mer information om oss finns på: Institutionen för biokemi och biofysik.

Projektbeskrivning

Vår forskargrupp studerar epigenetisk reglering av den mänskliga hjärnans utveckling under normala och sjukdomsrelaterade förhållanden. Vi utvecklar och tillämpar avancerade tekniker inom encellsgenomik, multimodal genomik och spatial genomik för att förstå hur regulatoriska program påverkar utveckling, sjukdom och evolution.

Vi har tidigare utvecklat metoder för multimodal profilering av histonmodifieringar och kromatintillgänglighet på encellsnivå (Bartosovic et al., Nature Biotech., 2021; Bartosovic et al., Nature Biotech., 2022) samt för spatial kartläggning av epigenomet (Deng, Bartosovic et al., Science, 2022; Zhang et al., Nature, 2023).

Vi söker nu en forskare med experimentell inriktning för att undersöka hur olika mutationer i samma transkriptionsfaktor påverkar dess regulatoriska funktion. Vi använder p53 som modell för ett DNA-bindande protein och syftar till att förstå hur mutationer förändrar p53 bindningsställen i genomet samt om dessa förändringar kan identifiera mutationsspecifika molekylära sårbarheter.

Arbetsuppgifter

Arbetsuppgifterna omfattar:

• Utveckla och optimera metoder för kromatinprofilering på encellsnivå, inklusive DynaTag- och CUT&Tag-baserade metoder, i kombination med riktad genotypning.
• Odla, underhålla och karakterisera däggdjursbaserade cancercellsmodeller och bibliotek med TP53-varianter.
• Framställa sekvenseringsbibliotek för att undersöka p53 bindning till kromatin och regulatoriska histonmodifieringar.
• Samarbeta med övriga medlemmar i forskargruppen.
• Handleda projekt för masterstudenter och doktorander.
• Skriva rapporter, vetenskapliga manuskript och dokumentation.
• Förbereda presentationer och delta i internationella konferenser.

Behörighetskrav

En forskare anställs i huvudsak för forskning och ska ha avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen.

Bedömningsgrunder

Vid tillsättningen kommer särskild vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet. Doktorsexamen inom molekylärbiologi, cancerbiologi, epigenetik, genomik eller ett närliggande ämnesområde.

Den sökande ska även ha:

• Gedigen praktisk erfarenhet av molekylär- och cellbiologiska metoder, inklusive odling av däggdjursceller.
• Erfarenhet av att planera, genomföra och kritiskt utvärdera vetenskapliga experiment.
• Förmåga att utveckla, felsöka och optimera experimentella metoder.
• Dokumenterad vetenskaplig forskning med relevans för anställningen.
• God förmåga att kommunicera på engelska samt att arbeta både självständigt och i samarbete med andra.

Det är meriterande att ha erfarenhet av:

• Forskning inom p53, cancerbiologi, transkriptionsfaktorer eller kromatinreglering.
• Metoder för kromatinprofilering, såsom CUT&Tag, CUT&RUN eller ChIP-seq.
• Encellsgenomik och framställning av sekvenseringsbibliotek för nästa generations sekvensering (NGS).
• CRISPR-baserad genomredigering, poolade cellbibliotek eller funktionella genetiska screeningmetoder.
• Analys och tolkning av genomiska data med hjälp av R, Python eller liknande verktyg.

Vid bedömningen kommer även hänsyn att tas till vetenskaplig omdömesförmåga, organisationsförmåga samt förmåga att bidra konstruktivt till forskningssamarbeten.

Om anställningen

Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Tillträde 2027-01-01.

Vi erbjuder

Hos oss får du dynamiken i samspelet mellan högre utbildning och forskning som gör Stockholms universitet till en spännande och kreativ miljö. Du arbetar i en internationell miljö och får förmånliga villkor. Universitetet ligger beläget i Nationalstadsparken med goda förbindelser till city.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Upplysningar om anställningen lämnas av forskare Marek Bartosovic, [email protected].

Ansökan

Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.