Arbetsbeskrivning

Doktorandplats i Naturvetenskap, inriktning biologi   

Datadriven evolution och biologisk mångfald omfattar forskning som drar nytta av de massiva datamängder som genereras av tekniker såsom höggenomströmningssekvensering av genom och biom, kontinuerlig inspelning av video och ljud i naturliga miljöer, höggenomströmningsavbildning av biologiska prover samt storskalig fjärrövervakning av organismer eller livsmiljöer. 

I denna forskarutbildning kommer du att utforska hur organismers egenskaper och genom utvecklas under darwinistiskt urval. Du kommer att utveckla nya matematiska och beräkningsmässiga metoder för att förstå anpassning i komplexa miljöer, där olika selektionstryck ställer motstridiga krav på cellbiologin och leder till komplexa avvägningar. Till exempel sker bättre prestanda vid höga temperaturer ofta på bekostnad av sämre prestanda vid låga temperaturer, och bakteriell resistens mot antibiotika är ofta kopplad till långsammare tillväxt i frånvaro av antibiotika.

Ur detta perspektiv kan darwinistiskt urval ses som ett multiobjektivt optimeringsproblem, där selektionen strävar efter att balansera kostnader och fördelar med olika egenskaper för att optimalt positionera organismer i ett högdimensionellt egenskapsrum. Du kommer att undersöka om multiobjektiva optimeringsalgoritmer (MOO), som ofta används inom ingenjörsvetenskap, kan hjälpa oss att förstå hur organismer anpassar sig och utvecklas.

Du kommer att analysera stora multivariata dataset om genomsekvenser och organismers fitness, med hjälp av MOO-tekniker, maskininlärning och genomomfattande associationsstudier. Jäst och bakterier är dina huvudsakliga modellorganismer, men det analytiska ramverk du utvecklar kommer att vara brett tillämpbart.

Allmän information om att vara doktorand vid Göteborgs universitet finns på universitetets doktorandsidor: https://www.gu.se/en/doctoral-studies

Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor.

https://www.gu.se/utbildning-till-att-bli-forskare

Du finner mer information om tjänsten och hur man ansöker via https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar