Arbetsbeskrivning

Forskare inom encellstranskriptomik och evolution av interaktioner mellan insekter och värdväxter

En forskartjänst är tillgänglig i Mariana Bragas forskargrupp, Evolving Networks, vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) i Uppsala. Gruppens forskning handlar om att förstå hur artinteraktioner förändras i tid och rum, med fokus på interaktioner mellan fjärilslarver och växter samt på utveckling av fylogenetiska metoder.

Om jobbet

Du som får tjänsten kommer att arbeta med hur modularitet i värdspecifikt genuttryck utvecklas hos fjärilslarver, genom analys av data från encellstranskriptomik. Du kommer att ingå i en grupp som arbetar i gränslandet mellan evolutionsbiologi, anpassning till värdväxter och encellsgenomik, och du och dina kollegor ansvarar för att analysera befintliga sekvensdata för att jämföra hur celltypsspecifika svar på värdväxter har utvecklats. Arbetet är till stor del beräkningsbaserat och självständigt, och utförs i nära samarbete med övriga medlemmar i gruppen.

I dina arbetsuppgifter ingår:

• Att leda den encellstranskriptomiska analysen av befintliga data från två fjärilsarter, till att börja med en kvalitetsbedömning av tillgängliga sekvensdata
• Att placera dessa arter i ett jämförande ramverk tillsammans med befintliga data från andra arter, och undersöka om det är samma celltyper som svarar på olika värdväxter hos olika taxa, eller inte
• Att vid behov validera celltypsbestämningar med in situ-sekvensering
• Att skriva och medförfatta vetenskapliga publikationer samt presentera arbetet vid seminarier och konferenser
• Att dela metoder och kod med gruppen och stötta kollegor och studenter i att ta till sig encellsanalys – kunskapsöverföring är en uttalad del av tjänsten

Alla intresserade sökande uppmuntras att söka, oavsett ålder, nationalitet, kön, funktionsnedsättning, religion eller etnisk bakgrund. Gruppens gemensamma språk är engelska, och goda kunskaper i engelska är därför nödvändiga. För att framgångsrikt utföra de olika arbetsuppgifterna bör den sökande ta egna initiativ, kunna arbeta självständigt samt vara lösningsorienterad och kunna hitta kreativa lösningar på tekniska problem. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom samarbetsförmåga. Eftersom den sökande kommer att arbeta nära andra i gruppen krävs mycket god kommunikationsförmåga, gott bemötande och pålitlighet.

Din bakgrund 

Krav

• Doktorsexamen i evolutionsbiologi, genomik, bioinformatik, molekylärbiologi eller närliggande ämne
• Dokumenterad erfarenhet av att analysera data från encells-RNA-sekvensering, inklusive praktiskt arbete med hela analyskedjan från rådata till annoterade celltyper
• Erfarenhet av att arbeta med icke-modellorganismer, där referensresurser är ofullständiga och annotering inte kan tas för given
• Goda programmeringskunskaper (t.ex. R och/eller Python) och erfarenhet av att arbeta i en högprestandaberäkningsmiljö (HPC)
• Förmåga att arbeta självständigt, planera sitt eget arbete och driva ett projekt framåt
• Dokumenterad förmåga att självständigt driva forskning och publicera vetenskapliga resultat
• Mycket god förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska

Meriterande

• Erfarenhet av insekter, särskilt fjärilar (Lepidoptera) eller interaktioner mellan insekter och värdväxter
• Erfarenhet av jämförande transkriptomik mellan arter och av uttrycksevolution hos duplicerade genfamiljer
• Erfarenhet av in situ-sekvensering, spatial transkriptomik eller histologisk validering av transkriptomiska kluster
• Erfarenhet av att undervisa, handleda eller på annat sätt föra över metodkunskap till kollegor

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet: nyfikenhet, noggrannhet i analysen samt vilja att samarbeta och att förklara sina metoder för andra.

Om oss

SLUs Institutionen för ekologi är ett av nordens största centrum för ekologiforskning. Vi kombinerar ekologisk grundforskning och tillämpad forskning inom naturvård, viltförvaltning, skogsbruk och växtskydd.

Evolving Networks Lab är en del av enheten för insektekologi.

Vi inom enheten för insektsekologi försöker förstå insekterna bättre – hur de samspelar med varandra, med andra organismer (inklusive människor) och med den omgivande miljön. Vi studerar också insekternas evolutionära historia för att bättre förstå deras framtid. Den kunskap som vi uppnår kan användas inte bara för att bevara arter och ekosystem, utan också för att avgöra hur vi kan nyttja insekter hållbart. Vi samarbetar med många människor både inom och utanför akademin.

Läs mer om institutionen för ekologi på https://www.slu.se/om-slu/organisation/institutioner/ekologi/

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Uppsala, Sverige.

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 12 månader.

Omfattning:

100%.

Tillträde:

2026-11-01, eller enligt överenskommelse.

Ansökan:

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-10-16.

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.