Vi har kraften från över 40 000 studenter och medarbetare. Studenter som ger framtidshopp. Medarbetare som varje dag bidrar till att Linköpings universitet tar sig an samtidens utmaningar. Vår värdegrund vilar på trovärdighet, tillit och trygghet. Genom att vara modiga, tänka fritt och göra nytt skapar vi tillsammans, med stora och små handlingar, en bättre framtid. Välkommen att söka jobb hos oss! Om jobbet Arbetsuppgifterna definieras utifrån kompetens och intresse, men kommer i ett första skede omfatta underhåll och vidare utveckling av olika befintliga bioinformatiska arbetsflöden. Analyserna kommer till stor del att utföras på GPUer och en del av uppdraget kommer att omfatta arbete med effektiv datahantering och visualisering för att underlätta tolkning och i vissa fall klinisk rapportering. Arbetet utförs i nära samarbete med kliniskt verksam personal samt med Genomic Medicine Sweden. Rollinnehavaren kommer att vara inblandad i kontinuerlig utvärdering, utveckling och automation av robusta bioinformatiska analyser för att processa short- eller long-read sekvenser och RNA-seq för båda forsknings- och kliniskt bruk. Att vara intresserade av arbetsuppgifter som omfattar databashantering och mjukvaruutveckling vore positivt och erfarenhet med Python krävs. Rollen innebär ett samarbete med anställda inom såväl akademin som sjukvården och frågor kring datasäkerhet är viktiga. Faciliteten har därför ett eget kluster och de anställda väntas bidra med stöd till underhåll och uppdatering av mjukvaror här. Det kommer att finnas möjlighet till publicering och presentation av både tekniska och biologiska resultat och metoder. De kommer att jobba tillsammans med andra bioinformatiker, läkare och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten. Om dig Vi söker dig som tar ansvar för dina uppgifter och driver processer framåt. Du är strukturerad, gillar att samarbeta och kommunicerar väl med andra på ett lyhört och smidigt sätt. Vi ser att du har (krav): • Mastersexamen i ämne med relevans för tjänsten t.ex. bioinformatik, datavetenskap eller motsvarande • Minst två års erfarenhet av att arbeta i en forskningsmiljö med bioinformatik, genomik och tolkning av storskaliga data • En mellanliggande till avancerad kompetens i hantering av vanliga och specialiserade bioinformatikverktyg och programvara • Mellanliggande färdigheter i att utforma och implementera bioinformatiska pipeliner • God förmåga att kommunicera på engelska • Programmering i scriptspråk R på en avancerad nivå • Dokumenterad förmåga inom scriptspråket Python • Erfarenhet av att arbeta i linuxmiljö • Förmåga att effektivt kommunicera fullständiga bioinformatiska koncept till både tekniska och icke-tekniska målgrupper. • En god förmåga att hantera och prioritera uppgifter effektivt • En god förmåga att identifiera och lösa problem under dataanalys självständigt • Goda praktiska kunskaper inom statistik Det är meriterande om du har: • Kännedom om git, conda eller liknande • Kännedom om pipelineverktyg som Snakemake och Nextflow • Erfarenhet av containermjukvaror som t.ex. Singularity (Apptainer)/Docker/Podman • Erfarenhet av undervisning och utveckling av läromedel anses meriterande • Erfarenhet av analys av arraydata som t.ex. Illumina eller Affymetrix Din arbetsplats Du kommer arbeta på Clinical Genomics corefaciliteten som tillhör avdelningen för cell- och neurobiologi (CNB) på Instutitionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper (BKV).  Läs mer om vår verksamhet här https://liu.se/organisation/liu/bkv/cnb Om anställningen 2 tjänster.  Tidsbegränsad anställning 1 år med möjlighet till förlängning, heltid. Tillträde enligt överenskommelse Lön och förmåner Linköpings universitet tillämpar individuell lönesättning.  Läs mer om förmåner för anställda här. Fackliga kontaktpersoner Information om fackliga kontaktpersoner, se Hjälp för sökande. Ansökan Välkommen att skicka in din ansökan med CV och ansökningsbrev senast den 2024-03-29. Du söker denna anställning genom att klicka på knappen "Ansök" här nedan. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag kommer inte att beaktas. Vi välkomnar sökande med olika bakgrund, erfarenheter och perspektiv, det berikar och utvecklar vår verksamhet. För oss är det självklart att värna om allas lika värde, rättigheter och möjligheter. Läs om vårt arbete med Lika villkor. Välkommen med din ansökan! Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.